안철수 서울대 융합과학기술대학원장의 대선 출마 선언에 대해 박근혜 새누리당 대선 후보 측은 '만시지탄(시기가 늦었음을 한탄함)'이라 평했고 문재인 민주통합당 대선 후보는"환영한다"고 밝혀 대조를 보였다. 하지만 안 원장이 제안한 3자회동에 대해서는 두 사람 모두 즉답을 피했다.
박 후보 측의 이상일 대변인은 안 원장 출마 선언 후 "만시지탄의 감이 있지만 그래도 국민 앞에 입장을 밝혀 다행스럽다"고 논평했다. 그는 "정치쇄신에 대한 안 원장의 문제의식은 박 후보와 같다"면서도 "안 원장이 '독자노선을 유지할 것인가'라는 물음에 명확한 답변을 하지 않아 구구한 정치공학적 억측이 나와 선거판이 혼탁해지지 않도록 유념해주기를 바란다"고 일침을 놓았다. 이 대변인은 안 원장의 3자회동 제안은 "나중에 말씀드리겠다"고 답했다. 그는 "안 원장이 흑색선전 같은 낡은 정치를 하지 말자"고 한 데 대해서는 "새누리당이 줄곧 민주통합당에 촉구한 것"이라며 문 후보 측을 간접 비판했다.
문재인 후보는 안 원장이 대선 출마를 공식화하자 "환영한다"며 "정당의 변화와 새 정치를 이뤄가는데 크게 기여할 것으로 생각한다"고 말했다고 진선미 대변인이 전했다. 문 후보는 안 원장과 좋은 경쟁, 아름다운 경쟁을 약속했다. 진 대변인은 그러나 안 원장이 선의의 정책경쟁을 위해 제안한 3자회동에 대해 "너무 갑작스럽다" 며 "제안 자체의 의미를 진지하게 검토해봐야 할 것 같다"며 신중한 태도를 보였다. 그는 특히 "새로운 변화는 새누리당의 집권 연장을 막고 정권교체를 해야 가능한 일"이라고 강조해 안 원장을 통해 박 후보 측을 우회적으로 공격했다.