안심전환대출에 대한 수요자들의 열기와는 달리 은행권은 수익성 악화 우려로 속앓이가 깊어간다. 현재 시중은행의 기존 주택담보대출 평균 변동금리는 연 3.5%대로 이 금리 대출자들이 안심전환대출로 갈아타면 은행은 1%포인트에 가까운 대출금리 손실을 보게 된다. 안심전환대출은 중도상환수수료도 전혀 부과하지 못해 수수료 수익도 없다.

대신증권은 안심전환대출 1차 한도인 20조원이 소진된다는 가정하에 전체 은행권 손실이 1,400억~1,600억원에 이른다고 분석했다. 또 신한·국민·하나·우리 등 4대 시중은행은 주택담보대출 시장점유율에 따라 은행당 250억~500억원의 순이자이익 감소가 불가피하다고 내다봤다. 하이투자증권도 이번 안심전환대출로 은행권의 순이자마진(NIM)이 연간 0.01%포인트 하락할 것으로 예상했다.

여기에다 은행들은 안심대출로 전환한 규모만큼 주택금융공사가 발행한 주택저당증권(MBS)을 의무적으로 매입해야 한다. 은행 입장에서는 연 3% 중반의 주담대가 2% 중반의 MBS로 변경된다는 점에서 신규대출 20조원을 가정할 때 약 2,000억원의 이자이익이 감소하는 셈이다.