현재 메뉴로 올라 있는 유기농 농산물은 야채 40가지, 과일 10가지, 쌀·잡곡 30가지 등이며 두부·나물류·생면류 등 풀무원 냉장제품 100가지와 육류·닭고기·계란·반찬·김치·양념류등도 취급하고 있다.내추럴홀푸드의 가장 큰 특징은 국내 쇼핑몰 가운데 최초로 최적의 신선도를 유지하는 프레시배송시스템을 도입하고 있다는 점. 이 시스템은 수도권 일부 지역에서 3~4시간, 전국 어느 곳이나 24시간 이내에 냉동제품을 배송하는 선진물류체계이다. 고객중심의 쇼핑편의를 제공하고 있는 것도 내추럴홀푸드 사이트의 차별화 요소다. 고객의 원스톱 쇼핑이 가능하도록 할인점이나 백화점에서 상품을 구입하는 방법을 크게 18가지로 분류해놓았다. 이에 따라 고객이 상품 분류군을 선택하면 한 화면에서 3가지 정보를 동시에 받아볼 수 있다. 또 고객이 테마별로 손쉽게 상품을 고를 수 있도록 추석·건장보조·세트·허브상품 등 섹션별로 상품을 구성하고 있으며 다양한 이벤트로 실시하고 있다. 회원중심의 사이트도 강화했다. 회원에게는 기본적인 누적적립금을 제공하고 상품구매 때 구매금액의 5%를 누적적립금으로 되돌려줘 적립금이 2만원 이상일 때 적립금만으로 상품을 구입할 수 있는 혜택을 제공하고 있다. 내추럴홀푸드는 앞으로 3~4시간 배송시스템을 수도권 전지역으로 확대하고 맞춤상품코너를 운영, 주문판매도 실시할 예정이다. 국내 최초로 우수회원을 대상으로 고객이 구입한 상품을 받아본 후 결제하는 후불제도 도입할 계획이다.