헌법재판소의 결정에 대해 정치권의 반응도 엇갈렸다. 정리하면 한나라당은 “아쉽지만 존중”, 대통합민주신당 등 범여권은 “당연하지만 걱정”이라고 논평했다. 하지만 오는 4월 총선을 앞둔 민감한 시기인데다 특검 결과에 따른 역풍을 우려한 듯 언어 표현에는 최대한 신중을 기하는 모습이 역력했다. 일단 한나라당은 차기 정부의 국정운영 준비작업에 차질이 생기지 않을까 걱정하면서도 특검에서 별다른 내용이 나오지는 않을 것이라는 데 위안을 삼는 듯했다. 나경원 대변인은 10일 브리핑을 통해 “헌재가 이른바 ‘이명박 특검법’의 참고인 동행명령제 조항에 대해서만 위헌 결정을 내린 것은 매우 아쉽지만 헌재의 결정을 존중하겠다”고 촌평했다. 나 대변인은 “특검을 통해 다시 한번 진실이 명명백백 밝혀질 것”이라며 “대통합민주신당 등은 이 문제를 더 이상 국론분열과 정쟁의 대상으로 삼아선 안 될 것”이라고 강조했다. 이명박 대통령 당선인 측은 이와 관련한 언급을 최대한 자제하는 모습을 보였다. 주호영 당선인 대변인은 “당선인이 헌재 결정에 특별한 반응을 보이지 않았다”고 전했다. 반면 특검을 주도적으로 발의했던 신당 측은 수사 비협조 등으로 특검 수사가 유명무실해지지 않을까 하는 의구심을 나타냈다. 신당의 이낙연 대변인은 “동행명령에 대해서는 저희들의 생각과 다르지만 헌재의 판단을 수용한다”고 말했다. 특히 “그래도 수사가 어려워져서 여러 의혹들이 해소되지 못할까 봐 걱정”이라며 “특검의 비상한 노력을 당부한다”고 덧붙였다. 이날 창당발기인대회를 마친 이회창 전 한나라당 대표의 자유신당(가칭) 측도 “헌재 결정에 대해 절대 다수의 국민이 갖고 있는 의혹이 하루빨리 해소되길 바란다”는 일반론에 가까운 논평을 냈다. 천호선 청와대 대변인 역시 “헌재의 결정을 존중한다”며 “특검 수사가 차질 없이 진행돼 국민들의 의혹이 말끔히 해소되기를 기대한다”고 밝혔다.