아주대학교는 2025학년도 정시모집에서 전체 선발인원의 32.7%인 764명을 선발한다. 각 모집 군별로 △나군(218명) △다군(546명)으로 신입생을 선발한다.

△자유전공학부(자연‧인문)의 정시 나군 모집 △자연계열 모집단위 수능 선택과목 제한 폐지 △자연계열 모집단위에 선택과목별 가산점 부여 △첨단학과 신설이 지난해와 비교해 달라진 점이다. 자연계열 모집단위에서 수학(미적분/기하), 탐구(과학탐구)를 선택했을 경우 수학의 표준점수, 탐구의 백분위 자체변환점수에서 3%의 가산점을 부여한다. 인문계열 모집단위의 경우 변경사항이 없으며 별도의 가산점을 부여하지 않는다.

수능 점수는 △국어, 수학은 표준점수 △탐구는 각 과목의 자체 변환점수 △영어는 등급별로 별도 변환점수를 활용해 반영한다. 탐구 영역의 자체 변환점수는 수능 시험 성적 발표 후 아주대학교 입학처 홈페이지에서 확인할 수 있다. 영어 과목 변환점수는 등급에 따라 모집단위별 지정된 변환점수가 부여되며, 한국사는 5등급 이하의 경우 등급별 감점이 적용된다.

일반전형1(의학과)과 농어촌학생전형(의학과)은 나군에서 수능 95%, 면접 5%로 진행되며 각각 50명과 1명을 선발한다. 면접평가는 제시문 기반 면접과 함께 지원자의 학교생활기록부를 바탕으로 개별면접으로 진행한다. 제시문 기반 면접은 정해진 시간 동안 제시문을 읽고 해당 제시문에 대한 질의‧응답을 바탕으로 진행한다.

나군 일반전형2(약학과, 자유전공학부)와 다군 일반전형3(의학과, 약학과, 자유전공학부 제외), 일반전형4(교차)는 수능 100%로 선발한다. 자연/인문 계열 구분없이 국어, 수학(선택과목 제한 없음), 영어, 탐구(사탐‧과탐 중 택2), 한국사 과목을 반영한다.

2025학년도부터 첨단바이오융합대학도 신설된다. 첨단바이오융합대학은 첨단바이오 분야 전문성과 현장실무능력을 갖춘 인재 양성에 목표를 두고 있다. 단과대학 단위로 모집하며, 입학 후 글로벌 혁신 신약 개발 전문가를 양성하는 ‘혁신신약공학전공’, 생물 공정 공학 관련 연구자를 양성하는 ‘바이오첨단소재공학전공’ 중 선택할 수 있다.