현 수석과 최원영 고용복지수석이 반장을 맡는 대책반은 기획, 재난안전, 보건복지, 행정자치, 경제금융, 법무, 외교, 치안 등 관련 비서관으로 구성됐다.
대책반은 보건복지부와 국민안전처 등 관련 부처의 상황 대책반 채널을 가동해 필요한 긴급 대책이 차질없이 수행될 수 있도록 상황 관리를 철저히 해나간다는 방침이다.
또 매일 상황 점검회의를 개최해 정부의 대응 상황, 추가 확산 방지대책, 상황단계별 부처협조사항, 보완대책 등을 중점적으로 논의할 계획이다. 대책반은 메르스 관련 상황이 안정될 때까지 운영된다.