이 의원은 지난 15일 가진 일부 언론과의 간담회에서 "미국에는 국가가 있지만 우리나라에는 국가가 없다"며 애국가를 부정하는 발언을 했다. 이에 새누리당이 곧바로 이 의원을 비난했고 17일에는 선진통일당에 이어 민주통합당도 논평을 냈다. 김현 민주통합당 대변인은 "애국가는 2010년 제정된 국민의례규정에서 법적 근거를 부여 받았다"며 "이 의원에게 국민의 눈높이에서 생각하고 실천하는 상식의 정치를 주문한다"고 말했다.
'대한민국을 정체성마저 부정하는 종북 좌파의 막장 드라마'라고 비판했던 새누리당의 황우여 대표는 "종북 좌파의 국가기밀 접근과 유출을 막기 위한 기밀 접근 체계를 재점검하고 강화해야 한다"고 말했다.
애국가 부정 발언 파장이 여론의 뭇매를 맞자 이 의원은 17일 뒤늦게 "발언의 취지가 잘못 전달됐다"고 해명했다.
일각에서는 이 의원의 계속되는 돌발 발언에 대해 "문제의 본질이었던 부정경선에 대한 검찰 수사의 압박이 턱밑까지 다가오자 종북 발언으로 본질을 희석하려는 것 아니냐"는 지적도 내놓고 있다.