조 후보자 의혹을 둘러싼 검찰과 청와대의 정면충돌 양상은 지난 6일 저녁 검찰이 조 후보자 부인 정경심 동양대 교수를 전격 기소하면서 정점을 찍었다. 단 한 차례의 소환조사 없이 청문회 종료를 앞두고 동양대 발급 표창장에 대한 사문서 위조 혐의로 정 교수를 불구속 기소하자 검찰 내부에서도 ‘이례적’이라는 목소리가 나왔다. 검찰이 조 후보자 의혹과 관련해 30여곳을 동시다발적으로 압수수색한 것을 놓고도 청와대와 조 후보자를 고립시키려는 윤 총장의 의중이 철저하게 반영된 것이라는 분석이다. 전례 없는 속전속결로 압수수색을 단행했지만 모든 의혹의 당사자인 조 후보자의 서울 방배동 자택과 서울대 연구실은 제외됐기 때문이다. 검사장 출신의 한 변호사는 “조 후보자 자택과 연구실을 압수수색에서 제외한 것은 검찰이 이미 충분한 증거를 확보했다는 자신감의 표출이자 마지막 결정적인 한 방을 아껴두고 있다는 의미”라며 “윤 총장이 일사불란하게 압수수색을 전개한 것도 검찰 조직을 조기에 장악했다는 신호를 청와대에 보내고 있는 것”이라고 말했다.
검찰 안팎에서는 문재인 대통령의 조 후보자 임명과 별개로 검찰이 관련자 소환과 수사에 더욱 속도를 낼 것으로 내다본다. 딸 입시부정 의혹의 핵심 인물인 정 교수에 대한 추가 기소도 금명간 이뤄질 것으로 전망된다는 관측도 잇따르고 있다. 하지만 청와대와 여당이 연일 검찰에 경고를 내보내고 있고 검찰도 강하게 반발하고 있어 양측의 ‘강대강 대치’가 불가피할 것으로 전망된다.
