양파의 게놈크기는 16Gb(160억쌍 염기)로 3Gb인 사람보다 5.3배 큰 거대 게놈을 가지고 있다.
이번 연구는 농진청이 개발한 ‘엄지레드(자색양파)’와 ‘신선황(황색양파)’에서 3만5,505개의 유전자를 찾아냈다.
이번에 발굴한 3만5,505개의 유전자를 양파 조직별로 특이유전자를 분석한 결과 약 15.9%인 5,678개의 유전자 중 887개는 뿌리에서, 2,808개는 줄기·잎, 1,321개는 꽃, 662개는 구에서만 특이적으로 나타나는 것으로 확인했다. 또 약 9%에 해당하는 3,223개의 유전자는 국제유전자목록 정보자료(미국 NCBI)에도 등록되지 않은 새로운 유전자로 확인됐다.
이번에 구축한 유전자는 첨단염기서열해독장비와 자체개발한 염기서열 분석방법으로 세계 최초로 작성됐다고 농진청은 설명했다.
농진청은 구축한 유전자 정보는 양파의 약리성 물질 생산, 병원균 방제, 신품종 육성 등 양파 연구 전반에 활용할 예정이라며 장기적으로 양파의 종자 자급률을 높이기 위해 종자 기업과도 협력해 활용할 계획이라고 밝혔다. 특히 앞으로 유전체 정보와 유전자 기능 분석까지 확대해 암 예방, 노화 억제, 고혈압 예방, 신진대사 촉진 등 다양한 유용유전자를 발굴하면서 지적재산권을 확보할 수 있어 산업재산권의 대량 창출도 기대된다고 덧붙였다.
농진청 손성한 유전체과장은 “양파 유전체 해독으로 얻는 유용 형질의 분자육종 마커개발기술은 90% 이상 일본으로부터 수입되는 양파 종자를 국내 육성 종자로 대체할 수 있는 종묘산업의 기폭제가 될 것”이라고 말했다.
